L’importance des perturbations occasionnées par le Rat noir sur l’avifaune des Ilets de Saint-Anne a conduit le Parc naturel régional à tenter en 1999 l’éradication du rongeur simultanément sur les quatre îlets selon le même protocole que celui mis en œuvre sur l’îlet à Fajou en Guadeloupe. Ce n’est qu’après la troisième opération de vérification en février 2003 que l’éradication de la population de rongeurs de la Réserve naturelle des îlets de Sainte-Anne a été considérée comme acquise. Dès 2001, sur l’ilet Hardy, la réduction importante des effectifs de rats s’est traduit par une augmentation spectaculaire du succès reproducteur du Puffin d’Aubudon (Puffinus lherminieri) qui est passé de 0% en 1999 à 90% en 2001 et une augmentation significative de l’indice d’abondance du Crabe zombi (Gecarcinus ruricola), espèce terrestre fortement menacée des Antilles (Lorvelec et al. 2001, Pascal et al. 2004). Chaque année, le Parc naturel régional réalise des opérations de contrôle de la dératisation en collaboration avec des associations (« AOMA », « Le Carouge », « SEPANMAR »). Le Rat noir a été à nouveau détecté en 2006, 2010 et 2011 et depuis 2011 aucune présence de rat n’a été relevée sur les 4 îlets de la réserve.