La présence du Rat noir a été mise en évidence en 2004 dans tous les îlots du lagon de plus de 0,1 ha (Rocamora, 2004). Dans certains îlots comme les îlots Hajangoua, ils étaient présents en très fortes densités et seraient ainsi responsables de la rareté des oiseaux marins nichant sur ces îlots (Rocamora, 2004 ; Rocamora et al., 2010). Dans la Réserve naturelle nationale de M’bouzi, les rats noirs consomment les boutons de fleurs de Vanilla humblotii, mettant en péril la reproduction sexuée de cette espèce endémique des Comores et emblématique de la forêt sèche (Bosca et Plouzennec, 2013 ; CBNM Mayotte, 2013). Dans la réserve, les rats noirs auraient également un impact négatif sur la reproduction du Souimanga de Mayotte (Nectarinia coquereli), du Foudi des Comores (Foudia eminentissima algondae) et du Paille-en-queue à bec jaune (Phaethon lepturus) (Bosca et Plouzennec, 2013). Le Héron crabier blanc (Ardeola idae) est l’espèce d’oiseau la plus menacée de Mayotte (UICN France, MNHN et GEPOMAY, 2014) et les rats pourraient être responsables de prédation d’oeufs et de poussins (Pusineri et al., 2012). (extrait de la stratégie de lutte contre les espèces animales invasives à Mayotte, 2015).